A pesquisa na FAP é considerada o centro promotor de produção do conhecimento. A Coordenação de Pesquisa tem como principal desafio incentivar professores e alunos da Faculdade a DESENVOLVEREM GRUPOS DE ESTUDO e PROJETOS DE PESQUISA como parte indispensável ao processo de ensino e aprendizagem.

Será iniciada, ainda no período 2010.1, uma campanha de incentivo à pesquisa intercursos, intitulada APRENDER PESQUISANDO, como método constante de ensino que visa relacionar TEORIA e PRÁTICA. O objetivo principal é convocar os alunos a buscarem o conhecimento para além da sala de aula.

A FAP também realiza anualmente no mês de dezembro o seu Encontro de Iniciação Científica, evento que vai para a sua terceira edição e muito estimula nossos alunos e professores a enveredar no campo das descobertas científicas. É um evento aberto a todas as IES do Ceará, com ampla divulgação e repercussão acadêmica e que já recebeu uma menção honrosa da Assembleia Legislativa do Estado do Ceará, quando em sua primeira edição.